2023年，杭錦旗漁業產值達7870萬元，水產品總產量達到2890噸，同比增長0.24%。近年來，杭錦旗漁業工作以水產綠色健康養殖“五大行動”為抓手，創新工作舉措，大力發展鹽堿水域特色漁業，推廣綠色高效多元化養殖模式，加快轉變漁業發展方式，大力推動產業融合，取得了顯著成效。

當前，杭錦旗水產總養殖面積達4.23萬畝，其中池塘養殖面積達2.2萬畝，湖泊面積1.7萬畝，水庫面積3825畝。全旗已建成標準化南美白對蝦淡化培育基地3處、標粗培育基地6處，年淡化南美白對蝦苗4100萬尾、標粗3500萬尾，成活率穩定在85%。完成池塘標準化改造4493畝，尾水處理后均能達標排放。推廣稻漁綜合種養1000畝，合理利用作物和水生動物之間的共生互促作用。發展螺旋藻養殖1500畝，提振經濟和農漁民增收致富。

此外，杭錦旗還加強同高校、科研院所開展科技攻關，承接水產新品種、新技術、新模式開展本地化試驗示范推廣，引進新品種中華絨螯蟹苗220余萬尾、加州鱸魚20萬尾，不斷優化養殖結構，提高名特優養殖品種比重。